Auswertung von Microarrays

Zielgruppe

Technische und wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter, die grundlegende Kenntnisse in Statistik und in der Erhebung von Genexpressionsdaten mit Microarrays besitzen

Inhalte/Lernziele

Der Ansatz der parallelen Erfassung von Genexpressionsdaten mit Hilfe der Microarraytechnik gewinnt in der biomedizinischen Forschung zunehmend an Bedeutung und verlangt nach entsprechend angepassten Designs und Auswertemethoden. In diesem Kurs werden klassische Lernverfahren zur Klassifikation von Genen und zur Diagnose von Patienten anhand von Expressionsdaten vorgestellt. Dabei werden Algorithmen der Clusteranalyse und der Diskriminanz-Analyse angewendet. Moderne Verfahren, die eine bessere biologische Interpretation von Genexpressionsdaten erlauben, werden behandelt. Testverfahren für die Analyse von Gengruppen werden vorgestellt, die in einem funktionalen Kontext, wie z.B. metabolische Pfade oder Onkogene, stehen. Mit solchen Methoden ist es möglich, eine Liste von differentiell exprimierten Genen zu erstellen.

Themenschwerpunkte

Clusteranalyse, Diskriminanz-Analyse, Analyse von Gengruppen