Molecular Modelling

Zielgruppe

Technische und wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter, die sich einen Überblick über Modellierungstechniken und deren Anwendung in der Industrie verschaffen möchten

Inhalte/Lernziele

In diesem theoretischen Kurs wird ein grundlegender Überblick über die modernen Computer Methoden zur Findung neuer Wirkstoffe vermittelt. Exemplarisch wird gezeigt, wie Substanzbibliotheken für biochemische Hochdurchsatzexperimente (HTS) durch spezielle Techniken (virtuelles screening) maßgeschneidert werden können. Die notwendige Optimierung der HTS aktiven Verbindungen (hits) kann über quantitative Struktur Wirkungsanalysen der Liganden oder mittels der Koordinaten des Zielproteins als molekularem Filter nach dem "Schlüssel-Schloss-Prinzip" erfolgen. Beide Verfahren werden Schritt für Schritt erklärt. Zur Berechnung von bioverfügbarkeitsrelevanten Eigenschaften stehen SoftwareTools zur Verfügung, die entweder kommerziell erworben oder selbst erstellt werden können. Den Kursteilnehmern werden ausgewählte Programme vorgestellt und der prinzipielle Aufbau eigener Tools erklärt. Außerdem wird auf grundlegende Experimente wie die Proteinkristallographie, die kombinatorische Chemie und das Hochdurchsatzscreening (HTS) eingegangen.

Themenschwerpunkte

Basisinformationen über Modelling Techniken, Hit und Leitstrukturidentifizierung, virtuelles Screening, Ligand und Strukturbasierte Leitstrukturoptimierung, de novo Design von Wirkstoffen, Ermittlung von bioverfügbarkeitsrelevanten Parametern