Statistische Auswertung von Microarrays

Inhalte & Lernziele

Die parallele Erfassung von Genexpressionsdaten mit Hilfe der Microarraytechnik gewinnt in der biomedizinischen Forschung zunehmend an Bedeutung und verlangt nach entsprechend angepassten Designs und Auswertemethoden. In diesem Kurs werden klassische und neue Verfahren zur Klassifikation von Genen und zur Diagnose von Patienten anhand von Expressionsdaten vorgestellt.

Themenschwerpunkte sind:

• Microarrays: Einführung & Grundlagen
• Differenzielle Analyse: Basismethoden (deskriptive Statistiken, Fold-Test, t-Test)
• Co-regulation: Basismethoden (Korrelation und Regression)
• Höhere gruppierende Verfahren: Algorithmen der Clusteranalyse
• Höhere diskriminatorische Verfahren: logistische Regression
• Analyse von Gengruppen
• Spezifische Analyse am Beispiel von metabolischen Pfaden und Onkogenen

Zielgruppe

Technische und wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter, die grundlegende Kenntnisse in Statistik und in der Erhebung von Genexpressionsdaten mit Microarrays besitzen.

Dozent

Dr. Joachim Brade studierte Volkswirtschaftslehre mit Schwerpunkt Statistik an den Universitäten Heidelberg und Mannheim. Seine Dissertation im Bereich Human-biologie erfolgte an der Medizinischen Fakultät der Universität Ulm. Er arbeitete an verschiedenen Forschungsinstituten, u.a. in der pharmazeutischen Industrie. Zurzeit ist er an der Medizinischen Fakultät Mannheim der Universität Heidelberg als Lehrbeauftragter für das Fach Biomathematik und Epidemiologie beschäftigt. Zu seinem Aufgabenbereich gehört auch die statistische Beratung von medizinischen Doktoranden und Ärzten am Universitätsklinikum Mannheim.

Dr. Britt Lemke studierte nach einer Ausbildung zur Biologielaborantin in Potsdam Biologie. 2004 promovierte sie am Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin in Berlin auf dem Gebiet der Hämatopoese. Im Anschluss arbeitete sie als Post-Doc in der Neurochirurgischen Universitätsklinik Heidelberg über Proteomics, Angiogenese, Tumorgenese und Immuntherapie von Hirntumoren. Seit September 2008 ist sie bei der PromoCell Academy als Labormanager und Dozentin tätig.