Programm
 
 

DNA Sequenzierung Labor-Kurs

Inhalte & Lernziele

In diesem Kurs lernen Sie die historische Entwicklung des DNA-Sequenzierens sowie die Möglichkeiten moderner HTS-Sequenziercenter und die Grundlagen des Next Generation Sequencing (NGS) kennen. Sie erfahren mehr darüber, wie eine eigene Sequenziereinheit aufzubauen ist bzw. anfallende Probleme mit schwierigen Sequenzierproben zu bewältigen sind. Die Inhalte konzentrieren sich auf die Sequenzierung von Plasmiden und PCR-Produkten. Sie bearbeiten den gesamten Prozess von der template-Präparation bis zur Auswertung der Sequenzen mit gängigen Softwarepaketen und Internet-Datenbanken.  

Im theoretischen Teil werden u.a. folgende Themen behandelt:

  • Grundlagen der PCR und DNA-Sequenzierung
  • Geräte-Übersicht
  • Präparation und Reinigung des Sequenziertemplates
  • Tricks und Tipps zum Sequenzieren schwieriger templates
  • Grundlagen des Next Generation Sequencings
  • Auswertung der Rohdaten, Analyse einfacher Elektropherogramme und Sequenzen aus gemischten klinischen Proben (ripseq)

Der Praxisteil umfasst:

  • Primer removal und Mengenbestimmung des templates
  • Isolation von DNA-Fragmenten aus Agarosegel
  • Sequenzierungsreaktion: PCR-Produkt und Fragment (BandPickTM-System)
  • Bedienung eines Kapillar-Sequenzierers am Beispiel des CEQ 8000
  • Auswertung mit den Programmen Chromas und ripseq

Zielgruppe

Technische und wissenschaftliche Mitarbeiter/-innen mit Grundkenntnissen in der Molekular-biologie.

Dozent

Dr. Johannes Becker-Follmann studierte Biologie und Philosophie in Saarbrücken und Freiburg. Er promovierte am Institut für Humangenetik und Anthropologie in Freiburg über “Vergleichende Genkartierungen bei Mensch und Maus“. Nach Forschungsaufenthalten in Osaka/Japan, Freiburg und Berlin gründete er im Jahr 2000 das Institut für Polymorphismus und Mutationsanalytik in Saarbrücken, das sich hauptsächlich mit der Analyse von DNA verschiedener Spezies beschäftigt. Seit 2002 führt er Seminare und Workshops zu PCR-Themen durch.

 

 

Empfohlene Aufbaukurse

Next Generation Sequencing & Library Preparation, Zell-Authentifizierung, genetische Stabilität und Nachweis von Kontaminationen