Protein- und Peptidanalytik mit MALDI-TOF MS

Inhalte & Lernziele

Die Analyse eines Proteoms erfordert wegen der enormen Komplexität schnelle Methoden zur Proteinidentifizierung. Da viele Komponenten eines Proteoms nur in sehr geringen Mengen exprimiert werden, müssen diese Methoden zudem eine hohe Nachweisempfindlichkeit aufweisen. Die Entwicklung schonender Ionisierungs-Techniken und die Fortschritte bei der Genomsequenzierung erlauben nun den Einsatz automatisierbarer und hoch sensitiver massenspektrometrischer (MS) Techniken zur Identifizierung von Proteinen. Eine der verwendeten Techniken ist die MALDI TOF MS (matrix-assisted laser desorption ionization, gekoppelt mit einem time of flight Massenanalysator). In diesem Seminar werden Sie mit den Grundzügen der Massenspektrometrie vertraut gemacht. Anschließend werden Ihnen die notwendigen Teilschritte einer Protein-Identifizierung mit MALDI-TOF bzw. MALDI TOF/TOF MS erläutert. Dieser theoretische Teil wird durch Demonstrationsversuche im Labor vertieft. Außerdem werden die Möglichkeiten, aber auch die Schwierigkeiten dieser Methode im Hinblick auf biologische Fragestellungen diskutiert.

Im Kurs wird Ihnen u.a. folgendes vermittelt:

• MALDI-TOF-MS von Biomolekülen
• Peaks und was dahinter steckt
• Grundlagen der Peptidsequenzierung
• Datenbanksuche zur Proteinidentifizierung

Zielgruppe

Technische und wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter ohne und mit Kenntnissen in der Massenspektrometrie.

Dozent

Dr. Thomas Ruppert promovierte nach dem Chemiestudium im Fachbereich Chemie der Universität Regensburg auf dem Gebiet der Proteinreinigung/Proteinanalytik. Als wissenschaftlicher Angestellter spezialisierte er sich auf Peptidanalytik in den medizinischen Fakultäten der Universitäten Ulm, Heidelberg, München und Berlin. Seit 2000 leitet er die Biomolekulare Chemie, die Zentraleinrichtung für Massenspektrometrie am Zentrum für Molekulare Biologie der Universität Heidelberg (ZMBH).